每年季節(jié)交替時(shí)出現(xiàn)的流感,突然的襲擊總會(huì)讓人猝不及防。而目前也并沒有針對流感的特效藥,只能通過疫苗預(yù)防。不過目前科學(xué)家已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)關(guān)鍵的蛋白——NS1 蛋白,它不僅可以幫助病毒躲避免疫系統(tǒng)的攻擊,還會(huì)大大增強(qiáng)病毒的感染力。
一項(xiàng)來自日本京都大學(xué)關(guān)于流感 A 病毒(Influenza A virus, IAV)非結(jié)構(gòu)蛋白 1(Non-structural protein 1, NS1)的研究,為我們揭示了這一病毒蛋白在病毒生命周期中鮮為人知的另一面——通過優(yōu)化病毒基因組的包裝,NS1 在無形中增強(qiáng)了病毒的感染力。
長久以來,NS1 蛋白因其在抑制宿主免疫反應(yīng)中的關(guān)鍵作用而廣受矚目。它如同一把精準(zhǔn)的鑰匙,能夠解鎖并干擾宿主細(xì)胞的抗病毒防御機(jī)制,特別是通過抑制 RIG-I 信號(hào)通路來阻止干擾素的產(chǎn)生,從而為病毒的復(fù)制創(chuàng)造有利條件。然而,這項(xiàng)最新研究卻讓我們看到,NS1 的功能遠(yuǎn)不止于此。
研究團(tuán)隊(duì)使用了一種特殊的病毒樣本,這種樣本缺少 NS1 蛋白。他們觀察了這種病毒在抗病毒缺陷細(xì)胞中的復(fù)制情況,并比較了有無 NS1 蛋白時(shí)的差異。
在整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程中,病毒的純化是非常關(guān)鍵的步驟
研究人員需要分離出純化后的病毒顆粒來進(jìn)行后續(xù)的實(shí)驗(yàn),包括分析病毒顆粒中 NS1 蛋白的含量以及病毒基因組的包裝情況等等。
▲ 在 10cm 培養(yǎng)皿中培養(yǎng)的 293 T RIG-I KO 細(xì)胞感染 PR8-delNS1 病毒后,用磷酸鈣沉淀法轉(zhuǎn)染 pEF-Bos-NS1
▲ 48 小時(shí)后,收集上清液,去除細(xì)胞碎片,然后用 RNAse A 處理以去除病毒顆粒外的 RNA
▲ 將處理過的上清液置于 30%(w/v)蔗糖墊上,使用 CP100NX 進(jìn)行超速離心(141,000 ×g,4℃,2h),純化病毒顆粒
此外,研究人員還使用了病毒樣顆粒(Virus-like particles, VLP)系統(tǒng),進(jìn)一步驗(yàn)證了 NS1 在病毒復(fù)制中的具體作用,同樣使用了上述蔗糖墊液超速離心法。
▲ NS1 對 VLP 在受體細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)導(dǎo)和感染的影響研究
好的研究成果離不開得力的實(shí)驗(yàn)工具,文中使用的 Eppendorf CP100NX(100,000 rpm, 803,000 xg)作為一款可靠的超速離心機(jī)設(shè)備,幫助研究人員獲得了純化后的病毒顆粒,為后續(xù)實(shí)驗(yàn)提供了可靠的材料。
▲ CP100NX 超速離心機(jī)
小 E 溫馨提醒:
文中使用的蔗糖墊液作為一個(gè)緩沖層,可以保護(hù)樣品免受離心管底部的直接沖擊,減少樣品的機(jī)械剪切力,從而保護(hù)敏感的生物分子結(jié)構(gòu),這種離心方法在病毒超速離心中較為常見。
最后的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在缺乏 NS1 的情況下,病毒的復(fù)制效率顯著降低,這一現(xiàn)象在先天免疫缺陷的細(xì)胞中尤為明顯。通過向 VLP 系統(tǒng)中引入 NS1 蛋白,研究人員發(fā)現(xiàn),NS1 能夠顯著促進(jìn)病毒基因組的包裝效率,從而提高了 VLP 的轉(zhuǎn)染能力。
這一發(fā)現(xiàn)揭示了 NS1 在病毒基因組包裝中的新角色
原來,NS1 不僅僅是一個(gè)免疫逃避者,它還是一位精明的“包裝師”。通過與病毒基因組的雙鏈 RNA(dsRNA)結(jié)合,NS1 能夠精確調(diào)控基因組的折疊和包裝過程,確保每個(gè)病毒顆粒都能攜帶足夠且完整的遺傳信息,從而提高了病毒的感染效率。
更為有趣的是,研究人員還發(fā)現(xiàn),NS1 的這一功能高度依賴于其 dsRNA 結(jié)合能力。當(dāng)他們通過基因工程手段引入 NS1 的 dsRNA 結(jié)合域突變體(如R38A)時(shí),NS1 的包裝促進(jìn)作用幾乎完全喪失。這一結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了 NS1 與 dsRNA 之間的相互作用在其優(yōu)化病毒基因組包裝中的關(guān)鍵作用。
這項(xiàng)研究揭示了一個(gè)潛在的抗病毒靶點(diǎn)——通過干擾 NS1 與 dsRNA 的結(jié)合,我們或許能夠阻斷病毒的基因組包裝過程,從而降低病毒的感染力。這無疑為流感病毒的防控和治療開辟了新的可能性。
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