《A conformation-specific approach to native top-down mass spectrometry》
文獻豐富了Native top-down質(zhì)譜法中離子淌度技術(shù)的應用,可以解析與主鏈解離構(gòu)象相關(guān)的差異,尤其可以應用于蛋白質(zhì)-配體復合物的結(jié)構(gòu)解讀。
《Resolving Hidden Solution Conformations of Hemoglobin Using IMS-IMS on a Cyclic Instrument》
文章采用離子遷移-質(zhì)譜(IMS-MS)實驗,研究了血紅蛋白四聚體(Hb)的15+ ~ 18+電荷態(tài)結(jié)構(gòu)的不均勻分布。通過獨特的變溫電噴霧電離(VT-ESI)實驗,結(jié)果表明,VT-ESI與IMS的結(jié)合對于解決和探索具有高度結(jié)構(gòu)異質(zhì)性的系統(tǒng)中的構(gòu)象分布和穩(wěn)定性是有用的。
《Full Separation and Sequencing of Isomeric Proteoforms in the Middle-Down Mass Range Using Cyclic Ion Mobility and Electron Capture Dissociation》
由于翻譯后修飾(PTM) 產(chǎn)生異構(gòu)體蛋白的多種組合,明確識別不同的蛋白形式及其生物學功能是一項重大的分析挑戰(zhàn)。串聯(lián)質(zhì)譜很難進行具有兩個以上異構(gòu)體混合物的單個異形的詳細結(jié)構(gòu)表征。大的同分異構(gòu)體肽和完整的同分異構(gòu)體蛋白很難用傳統(tǒng)的色譜分離方法進行區(qū)分?,F(xiàn)在,氣相離子分離技術(shù),如離子遷移譜(IMS)方法,提供了高分辨率,可以分離異構(gòu)體生物分子,如肽和蛋白質(zhì)。文章使用高分辨率環(huán)形離子遷移譜法(cIM),結(jié)合電子捕獲解離(ECD),用于分離和測序大型同分異構(gòu)體肽。結(jié)果證明了cIM-MS/MS(ECD)技術(shù)在增強中向下和自上而下的蛋白質(zhì)組學工作流程方面的潛力,從而促進了在復雜混合物中鑒定具有基本生物功能的幾乎相同的蛋白質(zhì)形態(tài)。
《Permethylation and Metal Adduction: A Toolbox for the Improved Characterization of Glycolipids with Cyclic Ion Mobility Separations Coupled to Mass Spectrometry》
糖脂在細胞信號傳導中發(fā)揮著重要作用,但與其他脂類相比,由于碳水化合物的引入及其相應的連接位置和頭部基團的a/?異構(gòu)性,糖脂表現(xiàn)出更大程度的異構(gòu)性。文章提出了一個分析工具箱,可以使用高分辨率環(huán)離子遷移率質(zhì)譜(cIMS-MS)來表征各種糖脂異構(gòu)體集。結(jié)合過甲基化和金屬加合,在cIMS-MS平臺上完全分離了異構(gòu)體鞘脂和神經(jīng)酰胺。
《Benefits and Limitations of High-Resolution Cyclic IM-MS for Conformational Characterization of Native Therapeutic Monoclonal Antibodies》
對于單克隆抗體(mab)分析,Cyclic IMS 質(zhì)譜使用碰撞誘導去折疊(CIU)方法,其更高的淌度分辨率用于:(i)揭示新的展開狀態(tài)和(ii)加強共存激活狀態(tài)的分離,從而允許人們直接在完整水平上理解單克隆抗體的氣相CIU行為。
《Collision Induced Unfolding Enables the Quantitation of Isomass Biotherapeutics in Complex Biological Matrices》
定量質(zhì)譜法已廣泛應用于多種生物基質(zhì)中分子濃度的測定。通常,這種定量質(zhì)譜分析是基于前體或片段離子的產(chǎn)生,這導致了圍繞異構(gòu)體或構(gòu)象不同分析物的定量的挑戰(zhàn)。因此,需要新的方法來實現(xiàn)同質(zhì)蛋白的無標記定量。Native離子遷移質(zhì)譜結(jié)合碰撞誘導去折疊(CIU)是一種潛在的定量質(zhì)譜方法,因為該技術(shù)可以快速分離和檢測許多生物大分子同種異構(gòu)體。CIU使用碰撞激活來捕捉離子在氣相中的展開軌跡,產(chǎn)生不同的中間結(jié)構(gòu),可以用來區(qū)分在較低能量下表現(xiàn)出相同大小的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
《Solution and Gas-Phase Stability of DNA Junctions from Temperature-Controlled Electrospray Ionization and Surface-Induced Dissociation》
DNA三向結(jié)(three-way junction, TWJ)結(jié)構(gòu)在轉(zhuǎn)錄、復制和DNA修復等關(guān)鍵細胞過程中短暫形成。盡管其意義重大,但TWJ的熱力學,包括鏈長、堿基對組成和配體結(jié)合對TWJ穩(wěn)定性和解離機制的影響,還尚不清楚。為了解決這些問題,我們將溫控納米電噴霧電離質(zhì)譜(TC-nESIMS)與配備表面誘導解離(SID)的環(huán)形離子遷移譜(cIMS)儀器結(jié)合起來。這種新穎的組合使我們能夠研究三種TWJ復合物的結(jié)構(gòu)中間體,并檢查GC堿基對對其解離途徑的影響。我們發(fā)現(xiàn)兩個TWJ特異性配體,2,7-三-萘(2,7- trisNP)和三-苯基醚(TrisPOB),導致TWJ穩(wěn)定,熔融溫度(Tm)分別提高13°C和26°C。為了深入了解氣相構(gòu)象的變化,我們使用cIMS和SID對TWJ及其配體配合物進行了分析。IM分布的分析表明,三種研究的TWJ復合物的TWJ及其中間體是一步解離的。在與配體結(jié)合時,誘導TWJ 50%的解離需要更高的SID能量(3v (2,7- trisnp)和5V (TrisPOB)),而在沒有配體的情況下為38 V。我們的研究結(jié)果證明了將TC-nESI-MS與cIMS和SID相結(jié)合用于TWJ配合物的熱力學表征和配體結(jié)合研究的能力。這些技術(shù)對于TWJ作為藥物靶點、配體和功能性生物材料的結(jié)構(gòu)單元的設計和開發(fā)至關(guān)重要。
《Increasing Coverage of the Urinary Polar Metabolome using Ultra High Performance Hydrophobic interaction Liquid Chromatography Combined with Linear Travelling Wave Ion Mobility and Cyclic Travelling Wave and Mass Spectrometry》
在代謝表型研究中,基于HILIC色譜柱的極性代謝物分離分析已經(jīng)得到了很好的應用。文章展示了通過行波(TW)離子遷移率(IM) 質(zhì)譜(MS)儀器結(jié)合HILIC對代謝型大鼠和小鼠尿液樣本獲得的極性代謝組的覆蓋率增加。此外,線性和環(huán)形IM (cIM)的使用提高了共洗脫分析物分離后獲得的質(zhì)譜數(shù)據(jù)質(zhì)量。與線性裝置相比,從環(huán)形IM-MS的路徑長度增加可以預期,HILIC-cIM-MS組合在特征檢測方面獲得了顯著的增益。
《Mobility-Modulated Sequential Dissociation Analysis Enables Structural Lipidomics in Mass Spectrometry Imaging》
基于質(zhì)譜成像(MSI)的空間脂質(zhì)組學是基礎生物學研究和生物標志物發(fā)現(xiàn)的有力工具。但由于缺乏多路串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)方法,MSI的結(jié)構(gòu)分辨能力受到限制,這主要是由于MS/MS分析中每個像素可獲得的樣本量小以及離子利用率差。文章報告了一種淌度調(diào)節(jié)的順序解離(MMSD)策略,用于從生物組織中提取不同脂質(zhì)的多重質(zhì)譜/質(zhì)譜成像。通過離子遷移支持的數(shù)據(jù)獨立采集和自動光譜反褶積,可以在不影響成像速度的情況下,從每個組織像素獲取大量脂質(zhì)的MS/MS光譜。MMSD成像通過對小鼠大腦中24種結(jié)構(gòu)獨特的脂質(zhì)進行MS/MS成像和揭示來自人肝細胞癌(HCC)組織的結(jié)構(gòu)獨特的磷脂酰乙醇胺異構(gòu)體(PE 18:1_18:1)的相關(guān)性而得到強調(diào)。這樣就可以繪制結(jié)構(gòu)上不同的脂質(zhì)異構(gòu)體成像,空間脂質(zhì)組學在MSI中變得可行。
《Formation and characterization of polymetallic {CrxMy} rings in vacuo》
了解大型金屬超分子的組裝機制對其設計、穩(wěn)定性和應用至關(guān)重要。這些結(jié)構(gòu)固有的復雜性導致了組合(或分離)組成模塊的許多潛在途徑,這使得這項任務變得困難。本文采用碰撞誘導解離質(zhì)譜法研究異金屬配合物的分解。碰撞激活導致了一系列以前未知的小環(huán)產(chǎn)物的形成,可以用離子遷移率來表征它們的幾何形狀。對{CrxCu2}沙漏結(jié)構(gòu)(x=10,12)和{Cr12Gd4}簇的分解表明,主要產(chǎn)物為稀有的封閉七金屬{Cr6Cu}、{Cr5Cu2}和{Cr5Gd2},以及{Cr5Cu}, {Cr10Cu}, {Cr12Cu}, {Cr10}, {Cr12}和{Cr6Gd2}等封閉離子。環(huán)產(chǎn)物和前驅(qū)體的碰撞截面與離子質(zhì)量呈線性相關(guān),這種關(guān)系在非環(huán)體系中不成立。由于這些環(huán)在溶液中單獨合成是有重要意義的,文章提出了現(xiàn)有的工作流程來識別和表征可用于體相合成的分子。
《General Method to Obtain Collision Cross-Section Values in Multipass High-Resolution Cyclic Ion Mobility Separations》
文中介紹了一種多圈環(huán)形應用場景下計算CCS的算法。
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