主要被用來鑒定有機化合物，對化合物的分子量、元素組成以及官能團等結構信息進行提供的儀器，被稱為有機質(zhì)譜儀。有機質(zhì)譜儀包括磁質(zhì)譜儀、飛行時間質(zhì)譜儀、離子阱質(zhì)譜儀以及四極桿質(zhì)譜儀。

離子源分類

1、光致電離源

7-16eV為大部分有機分子的電離能范圍，125-77.5納米為應真空紫外光的波長范圍。當對應波段的光子被待測物分子吸收以后，通常能夠發(fā)生光離解，使電離產(chǎn)生。分子的電離能一般使用光致電離技術。以激光技術為基礎的多光子電離和光致解離技術隨著激光技術在質(zhì)譜分析中的應用慢慢被發(fā)展了起來。

2、電噴霧電離源

電噴霧電離源作為一種電噴霧電離源，剛出現(xiàn)沒有多長時間。樣品中被分析物在強靜電場的作用下被離子化的一項電離技術，叫做電噴霧電離源。電噴霧電離為一種軟電離源，一些有著較差的穩(wěn)定性以及較大的分子量的化合物在電離過程中也不會發(fā)生解離。對于一些如糖、蛋白質(zhì)、肽等大分子化合物的分析非常適合。

3、快原子轟擊電離源

快原子轟擊電離源 為一種“軟”電離源，其是20世紀80年代慢慢發(fā)展起來的。

4、電子轟擊離子源

電子轟擊離子源為燈絲發(fā)出的一定能量的電子和樣品分子碰撞從而電離樣品分子。70eV為通常情況下燈絲發(fā)出的電離的能量。在這一能量下，許多分子均有碎片離子產(chǎn)生。

5、化學電離源

化學電離源一些化合物有著較差的化合物，電子轟擊離子源與樣品分子作用所產(chǎn)生的分子離子通常會進行進一步碎裂，從而造成僅可以使很弱的分子離子峰被檢測到或者根本不能檢測到。為了使分子離子，獲得，可以使用化學電離源。